はい、可能です。
仮払金の有無を条件として、承認フローを自動分岐させる設定および操作方法は下記の通りです。
１．条件の設定方法（出張申請の例）
（１）管理タブ > 機能設定 > 出張申請・出張精算を開きます。
（２）承認設定 > 出張申請 > 金額ルート > 金額ルート判定を「仮払金で判断する」に設定します。
２．承認フローの設定方法
（１）「プログラムID」部分で、対象とする機能にチェックを入れます。
（２）「金額」部分に「1」を設定します。
※金額に「1」を設定することで、「仮払金が1円以上ある（＝仮払金あり）」場合の承認ルートとしてシステムに認識させることができます。
３．実際の操作イメージ（出張申請の例）
（１）仮払金を希望する出張申請伝票を起票します。（承認依頼前の状態です）
（２）「承認依頼」ボタンをクリックすると、確認メッセージが表示されます。
（３）「OK」ボタンをクリックすると、設定した条件に基づき、自動で変更（分岐）された承認ルートを確認することが可能です。