日当マスターの設定を変更した場合、過去に承認された伝票やすでに出力済みのCSVデータ等に影響はありますか？

過去に承認済(完了)となった伝票データや、すでに出力された過去のデータに影響することはありません。

日当マスターの変更内容は、マスター更新後に新規作成・申請される伝票から適用されます。
そのため、日当マスターの変更を行っても、過去の確定データが変更されることはありません。