出張申請が承認された後に日当や宿泊手当などの設定を変更した場合、出張精算を行う際にエラーが発生しますか？

エラーが発生することはございません。

申請済みの出張伝票に設定変更前の日当や手当が入力されている場合でも、
設定変更によって精算処理時にエラーが発生することはありません。

ただし、申請時の明細には変更前の設定内容がそのまま反映されているため、
出張精算伝票の起票・申請を行う際には、精算伝票の明細にて
新しく設定した日当・手当へ付け替え（再選択）を行ってください。